那一天 我亲眼看着她消失在我面前
之后 偌大的城市在一瞬间化为废墟
为此 我必须
踏入这场超越时空的冒险之旅
在黑暗降临之前
拯救被抹杀的未来
……

AD 284年，阿鲁多和妹妹菲奈在月影森林被巴尔沃基村长发现，他们相亲相爱度过了美好的16年。但是在AD 300年，突然出现的魔兽王打破原本平静安稳的生活。魔兽王为了消灭全世界的人类，他需要借助菲奈的力量，于是把菲奈给掠走了。

在追赶魔兽王的途中，阿鲁多被次元漩涡所吞没，被传送到AD 1100年的曙光都市：埃尔吉昂，并在那邂逅了少女艾米，与她并肩作战，一起对抗向人类揭起反旗的合成人司令官：加里亚德。

成功打败加利亚德之后，能沐浴在喜悦的时间并不长久，转瞬之间艾米随埃尔吉昂居民都一个个在光芒中消失，连埃尔吉昂整座城市也在瞬间化为废墟。现在能够拯救“被抹杀的未来”，就只有可以穿越时空的阿鲁多……